Isomorphic Labs の創薬エンジンが AlphaFold を超える新境地を切り開く - Isomorphic Labs
概要
Isomorphic Labs は、構造予測と能力において AlphaFold 3 (AF3) を超える大幅な進歩を示す、統合された計算創薬システムである Isomorphic Labs Drug Design Engine (IsoDDE) を発表しました。
IsoDDE は、誘発適合や潜在的なポケットの開放といった複雑な事象を含む、新規システムに対する構造予測の一般化能力において、決定的な飛躍を示しており、困難なタンパク質-リガンド構造予測ベンチマークで AF3 の精度を 2 倍以上に向上させています。さらに、高忠実度の抗体-抗原インターフェース予測において AF3 より 2.3 倍優れており、複雑な生物学的製剤のモデリングにおいて精度の飛躍をもたらします。
最も重要な点として、IsoDDE は結合親和性予測において新たなゴールドスタンダードを確立しており、その速度とコストにおいて深層学習手法を大幅に上回り、実験的な結晶構造に依存しないにもかかわらず、物理ベースの手法を凌駕する性能を示しています。また、アミノ酸配列のみを使用して標的タンパク質上の潜在的なリガンド結合ポケットを特定する新規能力も備えており、cereblon 上で最近発見された潜在的なポケットの予測に成功するなど、新薬の合理的な設計を加速させます。
(出典：Isomorphiclabs)